ภาควิชาอายุรศาสตร์ มีการอบรมแพทย์ประจำบ้านต่อยอดอนุสาขาต่างๆ ทางอายุรศาสตร์ ได้แก่
- อนุสาขาอายุรศาสตร์โรคระบบทางเดินอาหาร
- อนุสาขาอายุรศาสตร์โรคต่อมไร้ท่อและเมตะบอลิสม
- อนุสาขาอายุรศาสตร์มะเร็งวิทยา
- อนุสาขาอายุรศาสตร์โรคหัวใจ
- สาขาประสาทวิทยา / อนุสาขาประสาทวิทยา
- อนุสาขาอายุรศาสตร์โรคติดเชื้อ
- อนุสาขาอายุรศาสตร์โรคระบบการหายใจและภาวะวิกฤตโรคระบบการหายใจ
- อนุสาขาเวชบำบัดวิกฤต
- อนุสาขาตจวิทยา
- อนุสาขาโรคข้อและรูมาติสซั่ม
