ภาควิชาปรสิตวิทยาดำเนินการวิจัยเกี่ยวกับปรสิตฉวยโอกาส เช่น อะมีบาที่อาศัยอยู่อย่างอิสระ โดยมีการศึกษาการสำรวจสิ่งแวดล้อมและการจำแนกชนิดของอะแคนทามีบาจากผู้ป่วยที่ติดเชื้อ ทีมงานของเราได้รายงานเคส Acanthamoeba keratitis รายแรกจากผู้ไม่ใส่คอนแทคเลนส์ที่ติดเชื้อ HIV ในประเทศไทย นอกจากนี้ยังได้ศึกษาสารสกัดจากสมุนไพรที่มีประสิทธิภาพในการต่อต้านหนอนพยาธิ Strongyloides stercolaris ซึ่งก่อให้เกิดโรคหนอนพยาธิที่ถูกละเลยทั่วโลกส่วนใหญ่ในผู้ป่วยที่ติดเชื้อเอชไอวี