กลุ่มวิจัยแมลงวัน ภาควิชาปรสิตวิทยาเน้นการศึกษาเกี่ยวกับแมลงวันที่มีความสำคัญทางการแพทย์และทางนิติกีฏวิทยา ซึ่งประกอบด้วยแมลงวัน 3 วงศ์ที่สำคัญได้แก่ แมลงวันหัวเขียว แมลงวันหลังลาย และแมลงวันบ้าน ปัจจุบันข้อมูลการศึกษา การวิจัย และการใช้ข้อมูลเกี่ยวกับแมลงวันในประเทศไทยยังมีข้อจำกัด